长期从事贝类贝类种质资源及其遗传改良研究，在我国近海开展了牡蛎种质资源评估、繁育增殖、杂交育种及细胞工程育种等工作；在我国深远海开展了砗磲人工规模化扩繁底播增殖技术研究，部分成果填补了国际空白。获得了7个省部级等科研奖励，主持国家贝类产业技术体系岗位科学家、国家自然科学基金等30个科研项目；累计发表学术论文189篇，以第一和通讯作者在iScience、Commun Biol、Sci Data、Food Chem、Aquaculture、STE等专业期刊上发表论文112篇；授权国家发明专利92项，其中9项已转化至企业，产生显著的经济效益；培育出国家级贝类新品种5个，对我国贝类产业发展做出了积极贡献。现任国家重点研发计划项目、国家自然科学基金等项目评审专家，多个SCI学术期刊编委。

2023-12至今 国家野外科学观测站（大亚湾站）副站长

2023-12至今 中国科学院南海海洋研究所 研究员

2021-12至2023-12 中国科学院南海海洋研究所 项目研究员

2016-12至2021-12 中国科学院南海海洋研究所 副研究员

2012-07至2016-12  中国科学院南海海洋研究所 助理研究员

1. 牡蛎种质资源与品种改良岗位（CARS-49），国家贝类产业技术体系岗位科学家项目（农业农村部），2023-2025，210万元. 

2. 广东生蚝优势特色产业集群，中央条件保障资金（农业农村部），2023-2026，360万元.

3. 典型广东贝类种质资源挖掘及其良种创制，广东省农业海洋牡蛎种业攻关（广东省农业农村厅），2023-2028，400万元.

4. 鳞砗磲自交家系的近交效应分析（31872566），主持：国家自然科学基金面上项目（国家基金委），2019-2022, 59万元. 

5. 砗磲外套膜颜色形成机制及其遗传分离机制研究（ZDYF2021XDNY135），主持：海南省重点研发计划项目（海南省科技厅）2021-2023, 50万元. 

6. 南海岛礁砗磲、牡蛎资源养护与增养殖（2020YFD0901102），主持：国家重点研发计划子课题（科技部），2020-2022，113万元. 

7. 牡蛎遗传改良体系构建及应用（2022YFD2400305），主持：国家重点研发计划子课题（科技部），2022-2025，50万元. 

8. 南海环境变化—关键生物种群繁育—砗磲繁育（XDA13020202），主持：中科院战略先导项目子课题（中科院），2016-2020, 1459万元. 

9. 钝缀锦蛤和大獭蛤人工扩繁及其遗传改良技术研究示范（GXCXQD2020），主持：广西创新驱动项目课题（广西科技厅），2020-2022, 337.5万元. 

10. 广东珊瑚、砗磲人工繁育技术研发及其应用（GDNRC[2022]40），主持：广东省自然资源厅科研项目, 2022-2024, 150万元.

1.近五年发表文章_39_篇、授权专利_12_件，新品种2个。

2.代表性论文（第一作者或通讯作者）：

（1）Li, J#., Ma, H#., Qin, Y#., Zhao, Z., Niu, Y., Lian, J., Li, J., Noor, Z., Guo, S., Yu, Z*., Zhang, Y*. Chromosome-level genome assembly and annotation of rare and endangered tropical bivalve, Tridacna crocea. Sci Data, 2024, 11: 186（二区, IF=9.8）

（2）Wan, W＃., Qin, Y＃., Shi, G., Li, S., Liao, Q., Ma, H., Li, J., Suo, A., Ding, D., Yu, Z*., Zhang, Y*. Genetic improvement of aquaculture performance for tetraploid Pacific oysters, Crassostrea gigas: a case study of four consecutive generations of selective breeding. Aquaculture, 2023, 563: 738910.（一区Top, IF=5.135）

（3）Guo, S., Li, J., Yang, X., Qin, Y., Zhao, Y., Wei, J., Zhao, L., Zhang, Y. Resistance of an intertidal oyster (Saccostrea mordax) to marine heatwaves and the implication for reef building. Sci Total Environ., 2024, 928: 172474.（一区Top, IF=9.8）

（4）Qin, Y., Shi, G., Wan, W., Li, S., Lio, S., Li, Y.,  Li, J., Ma, H. Zhang, Y*., Yu, Z*. Comparative analysis of growth, survival and sex proportion among tetraploid-based autotriploid (Crassostrea gigas and C. angulata) and their allotriploid oysters. Aquaculture, 2023, 563: 739026（一区Top, IF=5.135）

（5）Li, S＃., Qin, Y＃., Shi, G., Wan, W., Liao, Q., Ma, H., Li, J., Yu, Z., Pan, Y*., Zhang, Y*. Feasibility of interspecifc hybridization between Iwagaki oyster, Crassostrea nippona and Portuguese oyster, Crassostrea angulata. Aquaculture, 2023, 563: 739002（一区Top, IF=5.135）

（6）Qin, Y., Li, R., Liao, Q., Shi, G., Zhou, Y., Wan, W., Li, J., Ma, H., Zhang, Y*., Yu, Z*. Comparison of biochemical composition, nutritional quality, and metals concentrations between males and females of three different Crassostrea sp. Food Chemistry 2023, 398: 133868.（一区Top，IF=9.231）

（7）Qin, Y., Wan, W., Li, J., Wang, Z., Yang, Y.,Li, J., Ma, H., Yu, Z*, Zhang, Y*. A novel Fas ligand plays an important role in cell apoptosis of Crassostrea hongkongensis: molecular cloning, expression profiles and functional identification of ChFasL. Front Immunol. 2023, 14: 1267772（二区, IF=8.786）

（8）Zhang, Y*., Qin, Y., Yu, Z*. Comparative study of tetraploid-based reciprocal triploid Portuguese oysters, Crassostrea angulata, from seed to marketsize. Aquaculture 2022, 547: 737523（一区Top, IF=5.135）

（9）Zhang, Y., Zhou, Z., Qin, Y., Li. X., Ma, H., Wei, J., Zhou, Y., Xiao, S., Xiang, Z., Noor, Z., Li, J*., Yu, Z*. Phenotypic traits of two boring giant clam (Tridacna crocea) populations and their reciprocal hybrids in the South China Sea. Aquaculture 2020, 519: 734890.（一区Top, F=4.242）

（10）Li, J., Zhou, Y., Qin, Y., Wei, J., Shi, G., Ma, H., Li, Yunqing., Yuan, X., Zhao, L., Yan, H., Zhang, Y*., Yu, Z*. Assessment of the vulnerability of symbiont-bearing giant clams to ocean acidification. Sci Total Environ. 2022, 812, 152265.（一区Top, IF=10.753）

1.2022年度获聘“国家贝类产业技术体系岗位科学家”；

2.2023年度获聘“中国科学院特聘骨干人才”

3.2018年度获得“广州南沙新区科技创新领军人才”

4.2017年度广东省特支计划“青年科技创新拔尖人才”；

5.2023年度大连市科技进步奖一等奖（第六完成人）；

6.2021年度中国海洋科学技术奖一等奖（第七完成人）；

7.2020年度中国海洋科学技术奖一等奖（第六完成人）；

8.2019年度中国海洋工程科学技术奖一等奖（第二完成人）；

9.2019年度中国科学院集体科技成就奖（主要完成者）；

10.2019年度广东省科学技术进步一等奖（第七完成人）。