广东省海洋药物重点实验室依托于中国科学院南海海洋研究所，经广东省科技厅批准于2000年成立，2004年通过建设验收。实验室总体定位于应用基础研究，瞄准国际海洋生物医药研发领域的科学前沿和核心问题，面向国家和地方重大战略需求和国民经济主战场，以海洋特色药用生物资源的挖掘和可持续性利用、新颖药物先导物的发现和合成生物学产生体系、海洋生物功能大分子的绿色利用技术突破为关键科技问题。

实验室坚持基础性、前瞻性、战略性原则，成立二十多年来在海洋药用微生物资源、海洋天然产物发现及其生物合成、海洋药物先导物成药性评价和海洋生物制品研发方面取得了重要进展，相关成果取得了国家科学技术进步二等奖、国家技术发明奖二等奖、广东省专利金奖以及中国专利优秀奖等。实验室在深海微生物来源天然产物发现和生物合成领域处于国际领先地位，相关研究被Science杂志的观点文章（Perspectives）引用和评述，作为我国甚至全球深海微生物天然产物研究的代表。实验室对广东省乃至全国的海洋药物研究与开发起到重要的推动作用，其研究成果和人才培养为区域内海洋生物医药产业的发展提供了技术支撑和智力支持，促进相关产业高质量发展。