实验室立足南海及邻近海洋，围绕海洋环境安全保障、岛礁生态系统与安全、海洋资源开发利用等国家重大需求，深入开展热带海洋多时空尺度动力过程、岛礁环境响应过程研究，创新海洋非平衡态动力学理论，突破海洋观测、预报和综合治理关键技术。实现南海管辖海域及岛礁环境可知、变化可报、影响可控，服务海洋环境安全保障、权益维护和可持续发展。

实验室设有海洋科学、环境科学与工程一级学科博士后科研流动站及博士、硕士研究生招生点。招生专业具体如下：

博士招生专业：物理海洋学、海洋生物学、海洋生态学、海洋地质、环境科学

学术型硕士招生专业：物理海洋学、海洋生物学、海洋生态学、海洋地质、环境科学、环境工程、地质工程、生物技术与工程

专业型硕士：环境工程、地质工程、生物技术与工程