实验站建于1984年，隶属于中国科学院南海海洋研究所；1993年定为中国科学院开放站和中国生态系统研究网络重点站。2003年正式加入GTOS系统，成为其网络成员。作为中国科学院开放站和中国生态系统研究网络重点站，是中国亚热带海洋科学研究唯一的综合研究与技术支撑平台
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中国科学院海南热带海洋生物实验站（海南三亚站）始建于1979年，隶属于中国科学院南海海洋研究所。海南三亚站位于海南省三亚市最南端的著名鹿回头旅游风景区——鹿回头半岛，濒临珊瑚礁—红树林海区是我国唯一的热带海洋临海生物实验站。
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湛江海洋经济动物实验站成立于1963年，主要进行海洋经济动物（鱼、虾、贝、蟹等）的生物学研究，以及育种、养殖、病害防控、技术开发与推广等工作，同时开展相应海区的环境监测与研究。实验站本部位于湛江市区，占地7758平方米，建有一栋总建筑面积为3300平方米的实验大楼；在...
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汕头实验站于1978年成立，位于汕头市内。该站着重开展经济海藻的实验生态，生理等实验生物学的应用基础研究以及海洋植物资源开发的研究。近期主要研究琼胶海藻和药用海藻的实验生物学，了解海藻的生长，发育与环境条件的相互关系和它们的生理特性，培育适宜于本地区生长的优质...
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西沙深海海洋环境观测研究站 位于西沙群岛永兴岛，建于2007年，现有一栋实验楼，建有办公室、水文与气象实验室、水声学实验室、生物和化学实验室、会议室和专家及技术人员招待所。该站通过建立岛屿外缘坐底式海底和海底边界层观测子系统、上层海洋环境观测子系统、海洋物理环境...
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南沙海洋生态环境实验站位于南沙群岛美济礁，台站以中科院南海生态环境工程创新研究院、中科院岛礁综合研究中心为依托，占地面积12亩，包括海洋生物、海洋生态、海洋环境、水文动力观测等实验室，以及珊瑚原位长期生态观测系统、岛礁海洋环境与地质稳态观测系统等。
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