2008年6月20日，“热带海洋生态过程”创新团队项目负责人黄良民研究员和钱培元教授以及部分团队海外成员蔡卫君教授、李向东教授、王文雄教授等与团队所内成员欢聚一堂，进行了学术交流，各自汇报了团队运行以来的主要工作进展情况，并就中科院/国家外专局即将对团队项目进行评估和今后的运作、管理、合作方式、招生等进行了讨论。
     首先，黄良民副所长介绍了今年3月在北京召开的“创新团队国际合作伙伴计划”工作交流会情况、评估要求和团队项目整体进展情况，接着钱培元教授介绍团队合作研究及培养研究生和博士后等方面取得的进展并作了学术报告，蔡卫君教授、李向东教授、唐丹玲研究员、王文雄教授等分别介绍了各自的工作进展和下一步计划，并分别作了题为“Recent progress in coastal CO2 research”、“The Environmental Behaviors of Antibiotics and Heavy Metals in the Pearl River Estuary (PRE), South China”、“Influences of Ocean Hazards on Marine Ecosystem”、“The Environmental Behaviors of Antibiotics and Heavy Metals in the Pearl River Estuary (PRE), South China”等的学术报告，袁翔城博士代表殷克东研究员作了题为“Effects of UV on different trophic components: implication for carbon sink or source in South China Sea”的学术报告，邱大俊博士代表林森杰教授做了题为“Plankton species diversity and function: molecular approach”的学术报告。
     大家互相交流，介绍了相关专业领域前沿的学术进展、合作研究的初步成果、研究生培养情况和今后工作设想。从交流情况看，“热带海洋生态过程”创新团队获中科院/国家外专局批准试运行以来，在团队建设、合作研究、人才培养、合作申请项目等方面都取得成效和初步成果，合作研究工作进展顺利，并形成了良好的运行机制。为了使团队研究工作更好地展开，座谈会上大家畅所欲言，提出了许多建设性意见，包括建立海外创新团队网页，公布相关政策和管理条例、团队所取得的科研成果、设立团队成员主页，根据项目执行情况专门组织出海航次、公布南海海洋所出海航次计划和时间，招收研究生和研究助理，加强团队成员之间的联系以及信息交流等。
     根据团队试运行期间的进展情况，对团队所内成员进行适当调整和补充，明确今年联合招生计划，确定今年8月下旬，继续举办研究生课程（暑期班），联合申请开展有关珠江河口方面的研究工作等，最后项目负责人根据中科院/外专局今年3月底召开的“创新团队国际合作伙伴计划”工作交流会上的要求，对我们团队的下一步工作计划做了安排。
     讨论会后，钱培元教授的博士后朱玲进行博士后出站报告答辩，朱玲博士做了题为“不同水域微生物群落结构动力学及扇贝免疫相关基因的克隆与表达研究”的学术报告，顺利通过了专家组的评议。