南海海洋所科考船队建于1961年，在国家和科学院的支持下，随着科研工作不断开展和深入，南海海洋所的海洋科学考察船队也逐步建设，逐步壮大，由最初的一艘木质船舶到现代化先进的科学考察船，历经了近60年的发展壮大，从“珊瑚”轮到“实验”系列科考船，不断更新换代。现运营有“实验1”、“实验3”、“实验6”三艘3000吨级大型科考船舶。

南海海洋所海洋科学考察船队历经60余年的发展，从小木船到破浪巨轮，从最初的几个干部船员到现在140余人稳定的人才队伍，考察发展历史神圣而光辉。美丽的西沙、南沙群岛是调查船队考察的重点区域，从“六五”到“十三五”，每年均有专项考察航次。70年代考察队伍依托 “实验”轮用有限的条件获取最有价值的第一手具备战略意义的考察资料。80年代“实验2”、“实验3”科考船继续深耕南海，多次踏进西太平洋、东印度洋海域，出色地完成了南沙专项考察、863、973、908、126、602、基金委、水声专项调查等国家重大海洋科考项目。在1984-2004年期间，两船执行30余个南沙考察航次，在岛礁上树立了我国多处主权标志。

“实验”系列科考船已执行了447个科学考察航次任务，累计在航10214天，航程120百万海里，足迹遍及南海及邻近大洋。

“实验1”船是一艘小水线面综合考察船，总长60.9，型宽26米，型深10.5米，吃水6.5米，总吨3071，最大航速15节，经济航速11节，续航力8000海里，自持力40天，定员72人（科学45人 船员27人）。拥有13个各类专业实验室，配置先进的交流变频电力推进系统，全船减振降噪、自动化、动力定位等性能先进。满足水声学和海洋学发展的要求，适应学科交叉和综合的研究方法的变化，具有综合测量和观测网络的观察中心的功能。可实现对海洋声学以及相关的海洋环境参数进行同步观测、数据采集和采样，对声场进行精确预报，并对海洋进行声遥感。是我国高性能的水声研究平台及先进的海洋多学科实验平台。2009年投入以来执行了114个任务，海上作业2777天，航程32万海里（截止2024年5月）。支撑建设海洋强国战略，为我国重要装备的研发做出了重要贡献。

“实验3”轮是3000吨级的海洋综合考察船，1981年由上海沪东造船厂建造完成并投入使用。该船长104.21 米，船宽13.74米，吃水4.95米，双主机，4800匹马力×2，最高航速19.5节，续航能力8000海里，定员94人。该船拥有先进的G.P.S.导航系统和雷达避碰系统。温、盐、深探测系统，CTD-多瓶采水系统，化学分析极谱仪，浮游生物采集器，万米测深仪，波浪浮标，ADCP走航式探测系统，3000米生物绞车，3000米水文绞车，6000米地质绞车。配有水文、化学、生物、物理、地质等13个实验室。主要用于海洋环境，海洋生态，海洋生物资源开发和海气相互关系等方面的综合调查。1981投入以来执行了169个任务，海上作业4171天，航程54万海里（截止2024年5月），“实验3”科考船是我国自主建设的第一批大型海洋科学考察船，船龄虽超40年，至今仍可执行深海大洋考察航次，是我国海洋科学考察的功勋船。

“实验6”是国家发改委立项的中国科学院“十三五”科教基础设施建设项目，2021年正式投入使用，总吨3999，总长90.6米，型宽17.0米，型深8.0米，最大速度17.2节，续航力为12000海里，定员60人，自持力60天。具备全球航行和全天候观测能力，既突出地球物理专业调查功能，又能满足物理海洋、海气相互作用、海洋化学、海洋生物与生态等多学科综合考察需求；既能开展近海浅水区、大陆架、岛礁区的科学考察活动，又能在深海大洋极端环境进行全海深的探测和取样；配置学科齐全的现代化船载实验室，能现场进行多学科样品处理与分析，并实现与陆基实验室同步数据传输。

中国科学院南海海洋所科考船队拥有一套严密的、切实可行的船舶管理制度。并且在1997年是全国海洋科研单位首家通过了ISO9002质量管理体系的论证，管理规范化。船员均通过中国海事局按国际海事协会要求的安全专业技能培训，获得相应的适岗证书。成立了工程技术中心，负责船载实验室以及船载科考仪器设备日常维护管理，协助海洋样品采集以及科考数据的获取。

海洋科学考察船队在广州还配套有一个基地码头，可提供三艘3000吨级科考船同时靠泊，具有完善的供水供电设施以及相应的配套仓库和办公场所。该码头建于1982年的，泊位长115米，负水深7米。配有一台固定的3吨吊车，岸上占地面积达4200平方米。

南海海洋所海洋科学考察船队劈波斩浪六十载，率先满足国家任务的需求，为海洋物理、化学、生物、地质、海洋和大气环境、水声学等多学科交叉探索研究提供了坚实的海上实验平台，为我国海洋科考事业做出了重要贡献。